心”，要是让他率军去打台湾，说不定会跟郑克塽勾结。
玄烨却不这么认为。他召见施琅，问他：“你要是率军去打台湾，有把握吗？”施琅拍着胸脯说：“陛下放心，臣跟郑成功有血海深仇（郑成功当年杀了施琅的父亲和弟弟），臣这辈子最大的心愿就是收复台湾，为家人报仇，也为大清效力！只要陛下给臣足够的水师和粮草，臣保证半年内拿下台湾！”
玄烨相信了施琅，任命他为福建水师提督，让他负责训练水师，准备收复台湾。施琅果然没让人失望——他花了两年时间，训练出了一支强大的水师，还建造了很多战船，准备得差不多了。
康熙二十二年（公元1683年）六月，施琅率领水师两万多人，战船三百多艘，从福建厦门出发，向台湾进军。郑克塽得知后，派刘国轩率军在澎湖列岛抵抗——澎湖是台湾的门户，只要守住澎湖，就能阻止清军进攻台湾。
刘国轩在澎湖的各个岛屿上修筑了炮台，还派战船封锁了海面，想把清军挡在澎湖之外。施琅知道澎湖不好打，就采取了“声东击西”的战术——他先派一部分战船假装进攻澎湖的东侧，吸引刘国轩的注意力，然后自己率领主力战船，从澎湖的西侧进攻。
双方在澎湖展开了激烈的海战。施琅亲自率军冲锋，不幸被炮弹击中了眼睛，鲜血直流，可他还是坚持指挥战斗。清军将士看到主帅这么勇敢，士气大振，纷纷冲锋陷阵。刘国轩的军队抵挡不住，战船被烧毁了很多，士兵死伤惨重，最后只能率军逃跑。
澎湖失守后，台湾的军队人心惶惶。郑克塽知道自己守不住台湾，就跟冯锡范、刘国轩商量，决定投降清朝。康熙二十二年（公元1683年）八月，郑克塽派人给施琅送了降书，请求投降。施琅接受了投降，率军进入台湾，收复了宝岛。
消息传到北京，玄烨高兴得睡不着觉。他下旨，封郑克塽为公爵，让他带着家人到北京居住；还下令减免台湾的赋税，鼓励大陆的百姓去台湾开垦荒地，促进台湾的发展。
康熙二十三年（公元1684年），玄烨在台湾设立了台湾府，隶属福建省，还派了官员和军队驻守台湾。从此，台湾正式纳入了大清的版图，成为中国不可分割的一部分。施琅传》里记载：“二十二年，琅督师攻澎湖，克之，国轩遁归台湾。克塽大惊，遣使乞降。琅入台湾，抚辑遗民，疏请设官镇守。上从之，置台湾府，隶福建省。”
收复台湾，是玄烨的一大功绩。它不仅消除了清朝的“后患”，还促进了台湾和大陆的经济文化交流，为后来的“康乾盛世”奠定了基础。
收复台湾后，玄烨又遇到了一个麻烦——沙俄。当时的沙俄，已经开始向东扩张，他们越过乌拉尔山脉，侵入了中国的黑龙江流域，还在雅克萨（今俄罗斯阿尔巴津）和尼布楚（今俄罗斯涅尔琴斯克）建立了据点，经常骚扰当地的百姓，抢夺粮食和财物。
玄烨早就知道沙俄的野心。他在平定三藩、收复台湾的同时，也一直在关注黑龙江流域的情况。他曾派人去雅克萨，跟沙俄的将领谈判，让他们撤出中国领土，可沙俄将领根本不听，还说“雅克萨是沙俄的土地，凭什么撤走”。
玄烨知道，跟沙俄讲道理没用，只能用大炮说话。康熙二十四年（公元1685年），他任命彭春为都统，率领清军两千多人，加上当地的达斡尔族、鄂伦春族百姓，一起进攻雅克萨。
清军到达雅克萨后，先给沙俄将领托尔布津下了最后通牒，让他撤出雅克萨。托尔布津以为清军不敢打仗，还嘲笑清军“武器落后，根本打不过沙俄军队”。彭春忍无可忍，下令进攻——清军先用大炮轰击雅克萨的城墙，把城墙轰开了一个大口子，然后率军冲锋。沙俄军队抵挡不住，托尔布津只能率军投降，承诺永远不再侵犯雅克萨。彭春接受了投降，让沙俄军队撤出了雅克萨，然后一把火烧了雅克萨的据点，率军返回。
可没想到，彭春刚走，托尔布津就反悔了。他带着沙俄军队偷偷回到雅克萨，还把城墙修得更厚、更坚固，准备跟清军长期对抗。消息传到北京，玄烨气得拍了桌子：“这沙俄人说话不算数，必须给他们点颜色看看！”
康熙二十五年（公元1686年），玄烨任命萨布素为黑龙江将军，再次率军进攻雅克萨。这次清军吸取了上次的教训，不仅带了更多的大炮，还采取了“围而不攻”的策略——把雅克萨团团围住，切断沙俄军队的粮道和水源，让他们在城里自生自灭。
托尔布津一开始还很硬气，率军几次突围，可都被清军打了回去。没过多久，雅克萨城里就断粮了，士兵们只能吃树皮、喝雪水，还爆发了瘟疫，死伤惨重。托尔布津在一次突围中被清军的炮弹击中，当场死亡。剩下的沙俄士兵没了主帅，又饿又病，根本没心思打仗，只能派人向清军求和，请求解除包围。
玄烨知道，长期打仗对双方都没好处，就同意了沙俄的求和请求，下令停止进攻。康熙二十八年（公元1689年），清朝和沙俄在尼布楚举行谈判，签订了《尼布楚条约》。条约规定：黑龙