可王皇后不知道，武媚这是在“扮猪吃老虎”。她表面恭敬，暗地里却在拉拢人心，把宫里的眼线布得密密麻麻。同时，她也没忘了对付萧淑妃——萧淑妃骄纵，武媚就故意表现得温柔体贴、善解人意，还跟李治聊诗词歌赋、朝政见解，把李治迷得团团转。
没过多久，李治就很少去萧淑妃宫里了，心思全在武媚身上。王皇后一看萧淑妃失宠，正高兴呢，却发现不对劲——武媚的风头已经盖过了她这个皇后。李治甚至经常跟武媚商量朝政，要知道，古代后妃是不能干政的，这明显是把武媚当成了“红颜知己”。
王皇后这才慌了，赶紧跟萧淑妃联手，一起在李治面前说武媚的坏话。可李治早就被武媚迷得神魂颠倒，哪听得进去？反而觉得她俩是嫉妒，对她们越来越反感。
武媚看在眼里，知道王皇后和萧淑妃成了绊脚石，必须除掉。要废皇后，光靠宠爱不够，还得有个让大臣们无话可说的理由。这个理由，很快就来了。
永徽五年，武媚生下一个女儿，李治的第一个女儿，他高兴得合不拢嘴，经常来看。有一天，王皇后来看望小公主，武媚故意找借口出去了。王皇后逗了孩子一会儿，见武媚没回来，就先走了。
王皇后刚走，武媚就回来了。她看了看四周没人，咬了咬牙，亲手把女儿闷死，再盖好被子，装作什么都没发生。没过多久，李治来了，武媚笑着掀开被子，刚一看就“哇”地哭了：“我的女儿怎么死了？”
李治一看孩子没气了，急得直跳脚，问身边人：“刚才谁来过？”太监宫女早就被武媚收买，齐声说：“只有皇后娘娘来过。”李治火冒三丈：“肯定是皇后杀了我的女儿！”（《新唐书》载：“昭仪生女，后就顾弄，去，昭仪潜毙儿衾下，伺帝至，阳为欢言，发衾视儿，死矣。左右曰：‘后适来。’帝怒曰：‘后杀吾女！’”）
武媚在一旁哭得梨花带雨，嘴里念叨着“皇后为什么要杀我的孩子”，李治本就对王皇后不满，这下更是下定决心要废后。
废后可不是小事，得经过大臣们同意。李治先找了长孙无忌、褚遂良这些开国功臣商量。长孙无忌是他舅舅，还是宰相，说话分量重。李治以为舅舅会支持自己，没想到长孙无忌一口拒绝：“皇后是先帝选的，没大错，不能随便废。”褚遂良也跟着反对，还说：“武氏曾经侍奉过先帝，陛下要是立她为后，天下人会怎么看陛下？”（《资治通鉴》载：“遂良曰：‘武氏经事先帝，众所共知，天下耳目，安可蔽也？’”）
李治被怼得没话说，心里窝火。武媚知道后，没闲着，一边安慰李治，一边联络对长孙无忌不满的大臣，比如许敬宗、李义府。这些人一看武媚得宠，又有机会扳倒老臣，纷纷站出来支持废后。
许敬宗还在朝堂上公开说：“田舍翁多收十斛麦，尚欲易妇，况天子欲立后，何豫诸人事而妄生异议乎？”许敬宗传》）意思是，农民多收了点粮食还想换个老婆，陛下立皇后是家事，跟大臣们有啥关系？这话说到李治心坎里了，他更坚定了废后的决心。
永徽六年十月，李治下旨，废了王皇后和萧淑妃，把她们打入冷宫。一个月后，正式册立武媚为皇后。这一年，武媚三十二岁，从十四岁入宫到成为皇后，她用了十八年，终于站上了后宫的最高点。
可她没满足，皇后之位只是开始，她想要的是更大的权力。当时李治身体不好，经常头晕目眩，处理朝政很吃力。武媚就主动提出帮他处理政务，李治信任她，又觉得她有才干，便答应了。
一开始，武媚还只是在旁边出主意，后来直接参与决策。《旧唐书》里说她“自此内辅国政数十年，威势与帝无异”，当时人们甚至把她和李治称为“二圣”——一个皇后能和皇帝平起平坐，这在古代从未有过。
武媚掌权后，第一件事就是清算反对她的大臣。首当其冲的是长孙无忌，他根基深，不好扳倒，武媚就让许敬宗罗织罪名。许敬宗诬陷长孙无忌和韦季方谋反，李治一开始不信：“我舅舅怎么会谋反？”可许敬宗拿出“伪造证据”，武媚又在一旁吹风：“陛下，长孙无忌权势太大，要是真反了，后果不堪设想，就算是舅舅也不能姑息。”
李治本就软弱，被这么一忽悠就信了。显庆四年，长孙无忌被削去官爵，流放到黔州，没多久就被许敬宗派人逼得自杀。褚遂良、韩瑗这些反对者也没好下场，不是被流放就是病死他乡。武媚用铁血手腕扫清了障碍，把权力牢牢抓在手里。
她也不是只知道打压异己，还做了不少实事。比如重视人才选拔，原来科举多选士族子弟，普通百姓没机会，武媚就提出“广开才路”，不管出身，有本事就能考，还亲自出题考试，这就是“殿试”的雏形。（《新唐书》载：“太后不惜爵位，以笼四方豪桀自为助，虽妄男子，言有所合，辄不次官之，至不称职，寻亦废诛不少纵，务取实材真贤。”）后来的名相狄仁杰，就是这时候被提拔起来的。
她还重视农业，减轻赋税，鼓励开垦荒地，编纂《兆人本业记》推广农技。在她治理下