黄昏，修仙界共发现 5 名被种下种子的弟子，现代也发现 3 名灵族后裔，都用增强版灵火成功清除了种子 —— 但所有人都清楚，这只是冰山一角，两界肯定还有更多隐藏的种子没被发现。
第二天正午，双星交汇的时刻终于到来。林小满、苏晓通过灵族玉佩建立连接，灵界之心和时空之心同时爆发光芒，两道光柱穿过时空通道，在两界之间形成一道巨大的扫描网。扫描网慢慢覆盖两界，凡是被种下混沌种子的人，身上都亮起黑色光点 —— 修仙界有 12 个，现代有 8 个，其中最亮的一个光点，居然在柳如烟身上！
“柳师姐！是你！” 林小满不敢相信自己的眼睛，灵界之心的光芒对准柳如烟，她的丹田位置出现一个巨大的黑色光点，比之前发现的所有种子都大！柳如烟脸色惨白，下意识捂住丹田：“不可能…… 我一直跟你们在一起，怎么会被种下种子？”
灵汐突然想起什么，脸色凝重：“上次在混沌界，你为了保护我，被混沌蜥王的爪子抓伤过丹田！肯定是那时候被种下的种子！” 柳如烟愣在原地，慢慢放下手：“难怪最近总觉得丹田发沉，还以为是灵力消耗太大……”
“别担心！我们能清除它！” 林小满举起增强版灵火，却被柳如烟拦住：“不行！这颗种子太大，强行清除会伤到我的丹田，以后就不能修炼灵植术了！” 苏晓的声音从玉佩里传来：“我有个办法！现代的超导金属能制作‘种子容器’，先将种子转移到容器里，再慢慢净化 —— 就像现代的器官移植，先找个‘临时仓库’！”
制作种子容器需要时间，林小满决定先处理地脉中的混沌气息。根据灵界之心的指引，修仙界的地脉污染主要集中在陨星谷和灵族圣地，现代则集中在西郊古寺和时空锚点附近。两界同时行动，林小满带着灵汐和净化后的弟子去陨星谷，苏晓则带着现代的灵族后裔去西郊古寺。
陨星谷的地脉已经变成黑色，地面上的裂缝还在冒着黑烟。林小满将时空之心放在地脉中央，银色光芒渗入地面，黑色的混沌气息慢慢被吸出，凝聚成一团黑色的雾气。“快用两界灵火净化！” 林小满大喊，灵汐和弟子们同时举起灵火，金银光芒包裹住黑雾，雾气发出凄厉的惨叫，慢慢消散。
“这地脉净化比现代的河道清淤还麻烦！” 林小满擦了擦额头的汗，时空之心的光芒已经暗淡了几分。刚净化完陨星谷，灵族玉佩突然发烫，苏晓的声音带着急促：“小满！不好了！现代的地脉突然爆发大量混沌气息，混沌始祖的虚影出现了！它说要毁掉两界的地脉，让终极通道永远打开！”
林小满心里一紧，赶紧带着灵汐返回现代。刚踏入时空锚点，就看到一道巨大的黑色虚影漂浮在半空，正是混沌始祖！它的身体由无数黑色雾气组成，头顶的红色晶石泛着诡异的光芒，地脉中的混沌气息正源源不断地涌入它的体内！
“苏清欢，你们还是晚了一步！” 混沌始祖的声音震得地面颤抖，“地脉中的混沌气息已经被我激活，再过一个时辰，两界的地脉就会彻底被污染，到时候终极通道会永远打开，混沌界的魔物会淹没两界！” 它挥起触手，黑色光束射向时空之心，林小满赶紧举起灵界之心抵挡，两道力量碰撞，产生巨大的能量风暴。
“柳师姐！你怎么样？” 林小满大喊，看到柳如烟正用灵植缠住一只混沌魔物，丹田处的种子还在隐隐作痛。柳如烟咬着牙：“我没事！你们快想办法阻止混沌始祖，别管我！” 苏晓突然大喊：“我有办法！用时空之心和灵界之心的力量，结合两界地脉的灵力，发动‘两界净化阵’，能彻底清除地脉中的混沌气息！但需要有人守住阵眼，抵挡混沌始祖的攻击！”
“我来守阵眼！” 柳如烟突然冲上前，灵植藤蔓缠绕住时空锚点，“我的灵植能暂时加固地脉，你们快启动阵法！” 林小满眼眶发红，却知道现在不是犹豫的时候：“苏晓！灵汐！准备启动阵法！”
时空之心和灵界之心同时放在阵眼中央，金色与银色的光芒融合，形成一道巨大的光柱，插入地脉深处。混沌始祖察觉到危险，疯狂发动攻击，黑色光束一次次击中阵法屏障，屏障的裂缝越来越大。柳如烟的灵植也开始被混沌气息腐蚀，她的脸色越来越苍白，丹田处的种子开始剧烈跳动，随时可能爆发！
“柳师姐！撑住！” 林小满加大灵力注入，阵法的光芒越来越亮，地脉中的黑色气息被快速吸出，净化成金色的灵力重新注入地脉。混沌始祖的虚影开始变得透明，却仍不死心，凝聚所有力量，发动最后一击 —— 黑色光束直指柳如烟的丹田，想要引爆她体内的种子！
“不要！” 林小满毫不犹豫地冲过去，挡在柳如烟身前，灵界之心爆发出耀眼的光芒，挡住黑色光束。光束击中灵界之心，林小满喷出一口鲜血，身体倒飞出去，灵界之心也掉在地上，光芒暗淡了许多。
“清欢！” 灵汐和苏晓同时大喊，阵法的光芒也随之减弱。柳如烟趁机发动最后的灵植力量，藤蔓缠绕住混沌始祖的虚影，将它死